跟老婆异地两年，同城后不知怎么相处，是结束了吗？

通过您的描述，我不知道楼主现在同城深圳，感觉依然没有生活一起，不知道是什么原因。但是不管之前如何现在又如何。我给楼主的建议是，先确认一下，妻子是否有了其他想法，如果仅仅只是因为距离没有充分沟通接触导致你们现在的疏离感，并不代表结束。
我经历了近七年的异地恋，目前处于两地分居状态，你们的问题我不一定都有，但是你目前的这个我经历过。
找个时间和机会约她谈谈，关于你们的感情，你的感受，听听她的想法，她的感受。重新再追求一次，谈一次恋爱应该也没什么坏处。不管你们是如何相识相处，最后既然走到了结婚这一步，应该就会是有过亲密无间的。
也许目前你的，你们的状态并不代表结束，而是一段更加神器旅程的开始。
个人观点仅供参考。祝好。